2006年，为配合NDS版（钻石、珍珠版）的上市，TV动画同步推出全新系列《神奇宝贝钻石&珍珠》（Pokémon Diamond & Pearl，简称DP）。对战开拓区篇结束后，小遥为了独自挑战城都地区的华丽大赛和小智告别，小胜回到了橙华道馆，小刚也回家去了。小智则受到了小茂的激励，独自带着皮卡丘和偷渡的长尾怪手前往神奥地区挑战联盟小说背景　　新登场的女主角小光，其蓝本取自电玩...

　　千年一次的彗星之夜里，愿望将会实现…小说发布　　立志成为出色的神奇宝贝训练师的小智、小遥和小胜，带着皮卡丘展开了新的旅程。为了观看千年彗星出现的刹那，来到恩斯游乐场，并认识魔术师巴特勒与戴安。在魔术表演中，小胜听到一阵细微的呼唤声…　　那是在〝沉眠之茧〞中沉睡了千年，可帮助人类达成愿望的神奇宝贝——基拉祈。在千年彗星出现的夜晚，如果遇到拥有纯真心灵的伙伴便会苏醒。为了让基拉祈醒来，巴特勒请小胜...

　　小智（松本梨香 配音）一行人继续着磨练技艺的旅途，他们来到了欧鲁德朗城，这里正在举行为了纪念百年前阻止了战争的勇者亚朗而设置的对战祭典。小智带着皮卡丘（大谷育江 配音）勇敢参战，并且最终凭借着强大的实力夺得了头筹，获得了珍贵的宝物“勇者之杖”获奖情况　　然而，让小智没有想到的是 ，传说中的神奇宝贝路卡利欧竟然从杖中现身，它的重现江湖揭开了一个隐藏了百年的秘密。与此同时，神秘莫测的神奇宝贝梦幻现...

　　在代欧奇希斯（以下代欧）变成防御型态与裂空坐持续激战的同时，拉鲁斯市广播系统昭告大家紧急避难。市民们听到广播后便惊慌疏散。代欧此时又变成攻击型态，并对裂空坐释出攻击。广播持续呼吁民众这并非演习，而小超则在逃窜中的人群当中，大惑不解为何代欧还活着。当小超在避难时遇见一只难过的正电拍拍。小超一看到神奇宝贝顿时吓坏了，但听到它的求救声便镇静下来。原来它的同伴负电拍拍被陷进垃圾桶里无法挣脱，小超决定帮...

住在埼玉的菅原一家，正开车前往东京，准备和未来的亲家见面。此时，车中电台播送起一则传说……故事发生在东京屈指可数的名校白鹏堂学院，事情要从学生会长坛之浦百美（二阶堂富美饰），和从美国转校而来的麻实丽（GACKT饰）相遇说起。外表气质不凡，看似东京人的丽，其实是埼玉县人。对丽明里暗里庇护着埼玉人的行为，百美感到不解，却又情不自禁被丽所吸引。渐渐地，故事发展成一场东京和埼玉之间的抗争，甚至连隔壁的千叶...

续篇的舞台转到了群马改编作品。埼玉县的说唱歌手一宫和汤姆追寻乐坛传奇前辈武田的足迹来到了群马县。在那里他们遇到了自称是“武田首席弟子”的女子——阿步。阿步已经是“奔三”的年龄，她在父亲开的魔芋店里打杂，依然梦想着走音乐之路.........

小宫千寻（藤原夏海 配音）从小和母亲过着相依为命的生活，母亲不擅家事，家中的洒扫洗涮便都由千寻来承担，日子虽然过得拮据艰辛，但却十分的幸福快乐。然而，不幸忽然降临，母亲过世，千寻失去了最后的依靠。　　鹰取圆（岛崎信长 配音）是千寻的舅舅，他收留了无处可去的千寻，让他免费住在自己的家中。可是，这一举动却激怒了千寻，因为他深信工作是人生的唯一信条，只有靠工作换来的成果才能够心安理得的享用。鹰取圆是一位...

　　在东京的宁静角落，生活着幸福的三口之家。而今，这户人家迎来了新生命。爱撒娇的儿子小君，迎来刚出生的妹妹，他感到父母对自己的爱被妹妹夺走，正在恼怒之时，小君却在庭院中遇到来自“未来”的妹妹，并开启了穿越之旅，在家族之树的时空中，他和“未来”的妹妹一起，与童年的母亲、年轻时代的曾外祖父、甚至未来的自己相遇，在冒险中，小君领悟到不同形式的“家族之爱”喜剧片...

　　在某国立大学念书的花（宫崎葵 配音）与偶然来校旁听的男子（大泽隆夫 配音）坠入爱河，即使对方是一名狼人，她也义无反顾投入对方怀抱。此后的岁月里，花先后生下女儿小雪和儿子小雨。谁知厄运突然降临，温柔的丈夫撒手人寰。柔弱而坚强的花竭尽全力抚养两个孩子长大，吃穿用度，衣食住行 ，无一不牵扯她的心思。而子女狼人的身份也迫使他们离开繁华大都市，前往宁静的山野乡村求生。他们在一栋古旧的民房内落脚，小雪顽劣...

“我”（富泽风斗 配音）冥冥中来至天国，却被那个有些聒噪的使者普拉普拉拦住去路。在他所说，上帝给了十恶不赦的我一次重生的机会，以此体味和感受生命真正的价值。“我”不由分说被重新投回人间，灵魂进入了一个初三学生小林真的体内。小林真三日前见到了心仪的女孩桑园寻香（南明奈 配音）与中年大叔出入爱情旅馆，又见到母亲（麻生久美子 配音）不贞的举止，加上生活中的一切都让人绝望，于是他选择服毒自杀。苏醒后的“我...